pA-Transposase 是一种融合了 Protein A 结构域的工程化转座酶,其设计巧妙结合了转座酶固有的 DNA 切割与连接活性,以及 Protein A 结构域对多种物种 IgG 抗体 Fc 片段的高亲和力与特异性结合能力。通过结合目标蛋白的特异性一抗,它能够实现对染色质特定区域的精确定位,并引导转座酶完成该位点的 DNA 原位片段化与测序接头同步插入。作为 CUT&Tag 技术的核心组件,它驱动了该技术相较于传统 ChIP-seq 的显著优势:在极低细胞起始量下即可实现高信噪比、高分辨率的表观遗传学分析,背景噪音低且流程简化。其 Protein A 结构域对人源和兔源 IgG 抗体具有卓越的通用结合能力,确保了基于相应抗体体系的高效性与稳定性,尤其适用于人源或兔源抗体介导的组蛋白修饰、转录因子结合等高分辨率染色质分析。对于主要使用小鼠 IgG1 等抗体的研究,可搭配结合谱系互补的 pG-Transposase 以获得最优性能。
GeneRulor pA-Transposase
1. 产品简介
GeneRulor pA-Transposase 是一种高效的转座酶,通过蛋白质工程优化设计,融合了 Protein A 结构域,使其具备特异性结合抗体 Fc 片段的功能。这种新型转座酶不仅保留了转座酶的 DNA 切割和连接活性,还借助 Protein A 与抗体的高亲和力结合,实现了对特定染色质靶标区域的精确定位。作为 CUT&Tag 技术的核心组件,GeneRulor pA-Transposase 通过与目标蛋白的特异性一抗结合,可引导转座酶精准富集于基因组特定位点,实现原位 DNA 片段化与测序接头标记,为表观遗传修饰和转录因子结合位点的高分辨率分析提供理想工具。
相较于传统 ChIP-seq,基于GeneRulor pA-Transposase 的 CUT&Tag 技术具有样本需求少、信噪比高、操作便捷的显著优势。其核心的 Protein A 结构域对人和兔等多物种来源的 IgG 抗体(尤其是 IgG 的 Fc 区)具有普遍而强效的结合力,确保了在常用实验体系中的高效性与稳定性。这使得该工具特别适用于以人或兔源抗体为核心的表观遗传学研究,例如组蛋白修饰染色质分析。若实验主要使用小鼠 IgG1 型抗体,则可选择搭配结合谱互补的 GeneRulor pG-Transposase,为用户提供灵活精准的解决方案。
2. 应用领域
2.1. 表观遗传学研究
CUT&Tag技术:GeneRulor pA-Transposase 可与特定抗体结合,实现对感兴趣区域的精准标记和文库构建。其工作原理是通过抗体识别特定的染色质标记或 DNA 结合蛋白,将转座酶引导至目标位点,实现高特异性的 DNA 片段化和接头连接。这种技术特别适合研究低丰度的转录因子结合位点和特定组蛋白修饰,可显著提高测序效率和数据质量,降低背景噪音,为精准表观基因组学分析提供强大工具。

图1. GeneRulor pA-Transposase 用于 CUT&Tag 实验流程图
2.2. 二代测序(NGS)文库构建
GeneRulor pA-Transposase 是一种用于构建二代测序DNA文库的高效工具。其特点在于利用 GeneRulor pA-Transposase 二聚体的特殊转座机制,能够同时完成双链DNA的切割和接头连接两个步骤。这种酶具有快速反应能力,且所需样品量少,可在单一反应中将 DNA 打断并在两端添加特定接头序列。这一简化的‘’一步法‘’标记方法大大优化了实验流程,不仅节省了操作时间,还降低了实验成本,因此在 DNA 测序文库构建领域得到广泛应用。

图2. 构建二代测序文库工作原理图
参考文献
[1] Kaya-Okur HS, Wu SJ, Codomo CA, Pledger ES, Bryson TD, Henikoff JG, Ahmad K, Henikoff S. CUT&Tag for efficient epigenomic profiling of small samples and single cells. Nat Commun. 2019 Apr 29;10(1):1930. doi: 10.1038/s41467-019-09982-5.
[2] Farzad N, Enninful A, Bao S, Zhang D, Deng Y, Fan R. Spatially resolved epigenome sequencing via Tn5 transposition and deterministic DNA barcoding in tissue. Nat Protoc. 2024 Nov;19(11):3389-3425. doi: 10.1038/s41596-024-01013-y.