GeneRulor Tn5-Plus Transposase是针对传统Tn5转座酶存在序列偏好性这一行业挑战，通过基于三维结构的理性设计与多轮定向进化，对其非特异性DNA结合域进行精确改造而开发的新一代高活性、低偏好性转座酶。Tn5转座酶凭借其“cut-and-paste”机制，可一步完成DNA片段化与接头连接，将建库时间从数小时缩短至约10分钟，DNA起始量需求降至 ng 级别，已成为 WGS、ATAC-seq、CUT&Tag、转录组及单细胞测序等技术的核心工具，但其固有序列偏好性制约了数据均一性与真实性。Tn5-Plus 在保持并提升核心催化效率的同时，显著降低了插入位点的序列偏好性，从而在各类高通量测序应用中提供更均匀、更真实的基因组覆盖。该产品从根本上提升了测序文库的均一性和数据质量，为基因组学、表观遗传学及单细胞研究提供了更可靠、强大的技术基础，尤其适用于对数据均一性有严格要求的应用。
- 产品介绍
- 产品信息
- 产品说明书
GeneRulor Tn5-Plus Transposase
1. 产品简介
Tn5 转座酶凭借其独特的“cut-and-paste”机制，能够一步完成DNA片段化与接头连接，将传统建库流程从数小时缩短至约10分钟，并可将 DNA 起始量降低至 ng 级别。因此，它已成为全基因组测序、ATAC-seq、CUT&Tag、转录组分析及单细胞测序等技术的核心工具。然而，Tn5 转座酶固有的序列偏好性，也成为制约测序数据质量与均一性的关键瓶颈。
针对这一行业共性挑战，舒桐科技开发了新一代转座酶，GeneRulor Tn5-Plus Transposase。该产品基于Tn5-DNA复合物的三维结构，进行理性设计与多轮定向进化，对其靶 DNA 结合域进行了精准改造。GeneRulor Tn5-Plus Transposase在保持并进一步提升核心催化活性的同时，显著降低了插入序列偏好性，从而实现了更均匀、更真实的基因组覆盖，为各类高通量测序应用提供了更可靠的数据基础。
2. 产品特点
（1）精准设计：聚焦于靶DNA结合域进行系统优化，同时充分兼顾ME序列识别区与催化活性中心的结构完整性，在显著提升酶功能表现的同时，确保其核心催化机制稳定可靠。
（2）掺入序列偏好性显著降低：通过序列插入位点的Shannon 熵定量评估，GeneRulor Tn5-Plus Transposase展现出显著的序列偏好性降低。Shannon 熵作为衡量序列随机性的关键指标，其数值越高代表插入位点的分布越接近理想随机状态。实验表明，与野生型Tn5相比，GeneRulor Tn5-Plus Transposase在各类基因组背景下的插入分布更为均匀，有效减少了因序列偏好导致的覆盖偏差。这一改进从源头上提升了测序数据的无偏性与可靠性，为后续生物信息学分析提供了更真实、更一致的基因组图谱基础。
（3）全基因组覆盖更均衡：野生型Tn5转座酶在处理基因组中AT富集区域时，往往存在插入效率偏低的问题，导致这些区域覆盖不足，成为深度测序的数据盲区与偏差来源。GeneRulor Tn5-Plus Transposase显著增强了在这些高AT区域的识别与插入能力，从而大幅提升了该类区域的片段化效率。这一改进使得全基因组范围内的插入事件分布更为均衡，有效降低了因序列偏好引起的数据偏差，为下游分析提供了更全面、更真实的基因组覆盖信息。
（4）片段化活性更高：在相同反应条件下，GeneRulor Tn5-Plus Transposase的片段化效率高于野生型Tn5转座酶。其产物片段分布高度集中，主要位于200–500 bp的理想建库区间，有利于提高测序文库的有效数据产出，为高通量测序提供了性能更优的文库构建工具。
3. 应用领域
基于其全面优化的性能表现，GeneRulor Tn5-Plus Transposase不仅完全兼容野生型Tn5的所有应用场景，更能以更低的序列偏好性、更高的片段化效率及更稳定的酶活表现，为各类 NGS 应用提供更可靠的数据基础，尤其适用于对数据均匀性与完整性要求严格的关键场景：
（1）全基因组测序（WGS）：其更均一的 DNA 片段化能力，可有效减少基因组GC含量等因素导致的覆盖度偏差，获得覆盖更均匀的全基因组数据。
（2）ATAC-seq：在染色质开放区域研究领域，其低序列偏好性能更真实、全面地捕获全基因组的可及性位点，有效降低背景噪音，提升检测灵敏度。
（3）单细胞测序：面对极其有限的起始样本，其更高的酶活稳定性和切割效率，可确保在单细胞或极低起始量条件下，依然实现高效、均一的文库构建，最大程度保留生物学信息。
（4）转座子文库构建：作为核心工具酶，其优化的酶学性能可实现对目标DNA（如质粒、基因组、PCR产物等）的高效、随机打断与接头连接，构建覆盖度更完整的突变或测序文库。
（5）转录组测序及其他高通量文库构建：在 RNA-seq 等应用中，其低偏好性有助于获得更均匀的 cDNA片段分布，提升基因表达定量的准确性，尤其适用于复杂转录本或低丰度转录本的检测。
参考文献
[1] Li N, Jin K, Bai Y, Fu H, Liu L, Liu B. Tn5 Transposase Applied in Genomics Research. Int J Mol Sci. 2020 Nov 6;21(21):8329. doi: 10.3390/ijms21218329.
[2] Zhang H, Lu T, Liu S, Yang J, Sun G, Cheng T, Xu J, Chen F, Yen K. Comprehensive understanding of Tn5 insertion preference improves transcription regulatory element identification. NAR Genom Bioinform. 2021 Oct 27;3(4):lqab094. doi: 10.1093/nargab/lqab094.