GeneRulor ATAC-seq Library Prep Kit for Illumina
GeneRulor ATAC-seq Library Prep Kit for Illumina是一款为Illumina平台优化的、用于检测全基因组染色质开放状态/可及性的高效文库构建试剂盒。其核心技术利用经工程化改造的高活性Tn5转座酶，该酶能特异性进入并切割开放染色质区域，并在切割同时将测序接头直接插入，从而将染色质片段化与接头连接整合为一步“Tagmentation”反应。经后续扩增纯化，即可构建高通量测序文库。通过对接头序列的测序分析，可快速、灵敏地绘制高分辨率染色质可及性图谱，精准反映特定生物学状态下的表观遗传景观。该方法因所需细胞量少、周期短、背景噪音低，特别适用于肿瘤异质性、细胞发育与分化动态、衰老机制、干细胞多能性维持与分化等前沿表观遗传学研究，为深入解析基因表达调控的时空动态与分子机制提供了关键工具。
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GeneRulor ATAC-seq Library Prep Kit for Illumina
1. 产品简介
GeneRulor ATAC-seq Library Prep Kit for Illumina是针对Illumina高通量测序平台开发的用于研究染色质开放性/可及性的文库构建试剂盒。其原理是利用Tn5转座酶切割某种特定时空下的开放染色质区域，再通过高通量测序技术对Tn5带入的测序标记进行分析，即可获得该状态下全基因组的开发染色质区域信息。该试剂盒特别适合应用于肿瘤研究、发育生物学、衰老等表观遗传学领域，能够快速、精准地反映染色质的表观遗传状态，帮助科研人员深入探索基因调控机。
2. 实验原理
本试剂盒利用 Tn5 转座酶对开放染色质区域进行靶向切割，并在切割位点直接嵌入测序适配体。随后通过 PCR 扩增和纯化步骤，构建适用于 Illumina 平台的测序文库，实现对全基因组染色质可及性的高效分析。
图1. ATAC-seq实验原理图
3. 应用场景
（1）发育生物学与细胞分化：追踪胚胎/组织发育过程中染色质开放动态，揭示关键调控元件激活顺序。
（2）癌症与肿瘤表观遗传：比较肿瘤 vs. 正常组织染色质差异，鉴定肿瘤特异增强子及潜在药物靶点。
（3）免疫学与免疫细胞功能：分析T/B细胞、巨噬细胞等在激活/疾病状态下的调控景观，研究免疫应答机制。
（4）植物与农业生物学：解析植物生长、抗逆、代谢调控中的染色质变化，支持农艺性状改良研究。
（5）单细胞水平（scATAC-seq / snATAC-seq）：解析组织异质性、稀有细胞亚群的调控网络，常与单细胞RNA-seq联合构建GRN。
（6）空间表观遗传学（spatial ATAC-seq）：在组织切片中保留空间位置，同时分析染色质开放，构建时空调控图谱。
（7）其他交叉应用:神经退行性疾病、进化比较、药物筛选、微生物-宿主互作等领域的表观机制研究。