乙型肝炎病毒(Hepatitis B Virus,HBV)感染严重危及人类的健康,全球约有20亿人口感染,其中每年因 HBV 感染引发乙肝、肝硬化和肝癌死亡的人数约有120万。在中国,超过80%的肝癌患者均同时伴有 HBV 感染。HBV 主要通过接触受感染的血液或体液进行传播,大多数通过血液感染。现有研究表明,HBV 整合是导致癌变的关键机制,但是目前临床上常用的 HBV 检测仅能对起进行分型及定量,无法获取关键的HBV整合信息。GeneRulor HBV 捕获试剂盒基于 HBVdb 基因组数据库进行探针设计,全面覆盖 HBV 八种基因型(A,B,C,D,E,F,G,H)共4162余种型别的全长序列,可一次性分析乙肝病毒DNA水平上的整合断裂及游离 HBV 的鉴定分析,对于阐明与病毒相关的肿瘤发生发展机制具有重要的科学意义。
GeneRulor HBV 捕获试剂盒
1. 产品介绍
乙型肝炎病毒(Hepatitis B Virus,HBV)感染严重危及人类的健康,全球约有20亿人口感染,其中每年因 HBV 感染引发乙肝、肝硬化和肝癌死亡的人数约有120万。在中国,超过80%的肝癌患者均同时伴有HBV 感染。HBV 主要通过接触受感染的血液或体液进行传播,大多数通过血液感染。现有研究表明,HBV整合是导致癌变的关键机制,但是目前临床上常用的HBV检测仅能对起进行分型及定量,无法获取关键的 HBV整合信息。
GeneRulor HBV 捕获试剂盒基于 HBVdb 基因组数据库进行探针设计,全面覆盖 HBV 八种基因型(A,B,C,D,E,F,G,H)共4162余种型别的全长序列,可一次性分析乙肝病毒 DNA 水平上的整合断裂及游离 HBV 的鉴定分析,对于阐明与病毒相关的肿瘤发生发展机制具有重要的科学意义。
2. 产品应用
(1)准确分型:覆盖了目前所知 HBV 分型。
(2)病毒载量:可根据与管家基因的比较,评估病毒载量。
(3)确定是否整合:若检测到human- HBV 的融合reads,则判定为整合。
(4)整合位点检测:根据检测到的human- HBV 序列,比对回参考基因组,即可获取整合位点信息。
参考文献
[1]Tian, R. et al. Risk stratification of cervical lesions using capture sequencing and machine learning method based on HPV and human integrated genomic profiles. Carcinogenesis 40, 1220-1228, doi:10.1093/carcin/bgz094 (2019).
[2]Wu, C. et al. DeepHBV: a deep learning model to predict hepatitis B virus (HBV) integration sites. BMC Ecol Evol 21, 138, doi:10.1186/s12862-021-01869-8 (2021).