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GeneRulor NGS DNA 纯化磁珠

GeneRulor NGS DNA 纯化磁珠

GeneRulor NGS DNA 纯化磁珠基于固相载体可逆化固定原理开发,专为高通量测序文库构建中DNA片段的纯化与大小分选而设计。该磁珠表面羧基修饰丰富,能够在 PEG 缓冲体系下选择性地结合特定长度的DNA片段,有效去除接头二聚体、引物残留及非特异性扩增产物,显著提升文库质量。 本产品全面兼容 Illumina、MGI 等主流测序平台建库流程,可与各品牌 DNA 建库试剂盒及文献报道的实验方案无缝对接,操作流程与同类进口产品完全一致。文库产量、片段大小分布及回收率均与国际标准产品高度一致,可实现直接替代。同时,该磁珠批次稳定性好、磁响应迅速,既可手动操作,也适配自动化工作站。在保证优异纯化效果的前提下,能够有效降低建库成本,是 NGS 文库构建经济可靠的选择。


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GeneRulor NGS DNA纯化磁珠


1. DNA纯化

(1)将磁珠液提前30 min从2~8 ℃取出,静置使其温度平衡至室温。

(2)颠倒或旋涡振荡使磁珠液充分混匀,根据表1吸取适量磁珠液加入 DNA 样品中,使用移液器轻轻吸打10次充分混匀。

(3)室温孵育10 min,使 DNA 结合到磁珠上。

(4)将样品置于磁力架上,待溶液澄清后(约5 min),小心移除上清。

(5)保持样品始终处于磁力架上,加入200 μL新鲜配制的80%乙醇漂洗磁珠,室温孵育30 sec,小心移除上清。

(6)重复步骤5一次,总计漂洗两次。

(7)保持样品始终处于磁力架上,室温下开盖干燥磁珠约5-10 min。

(8)将样品从磁力架上取出,加入适量无核酸酶水,涡旋振荡或使用移液器吹打充分混匀,室温静置2 min。在磁力架上静置5 min待溶液澄清后,小心吸取上清至一个新的无核酸酶离心管中。

2. DNA纯化条件参考

纯化所得片段大小范围

参考纯化磁珠用量(磁珠体积用量:样品体积)

≥1 kb

0.5×

≥400 bp

1.0×

≥300 bp

1.2×

≥200 bp

1.5×

≥100 bp

2.0×-3.0×


图1. 不同磁珠用量对应的回收100 bp marker 结果图


3. DNA片段分选

(1)将磁珠液提前30 min 从2~8 ℃取出,静置使其温度平衡至室温。

(2)旋涡振荡使磁珠液充分混匀,按照分选条件说明吸取适量体积磁珠液(第一轮分选,参考表2)加入纯化后的 DNA 处理样品中,使用移液器轻轻吸打10次充分混匀。

(3)室温孵育10 min,使 DNA 结合到磁珠上。

(4)将样品置于磁力架上,待溶液澄清后(约5 min),小心吸取上清至一个新的无核酸酶离心管中。 注意:转移上清时,建议残留2 μL液体于管底,避免吸到磁珠并影响分选效果。

(5)加入适量磁珠液(第二轮分选,参考表2),使用移液器吸打10次充分混匀。

(6)室温孵育10 min,使DNA结合到磁珠上。

(7)将样品置于磁力架上,待溶液澄清后(约5 min),小心移除上清。

(8)保持样品始终处于磁力架上,加入200 μL 新鲜配制的80%乙醇漂洗磁珠,室温孵育30 sec,小心移除上清。

(9)重复步骤8一次,总计漂洗两次。

(10)保持样品始终处于磁力架上,室温下开盖干燥磁珠约5-10 min。

(11)将样品从磁力架上取出,加入适量无核酸酶水,涡旋振荡或使用移液器吹打充分混匀,室温静置2 min。在磁力架上静置5 min,待溶液澄清后,小心吸取上清至一个新的无核酸酶离心管中。


4. DNA片段分选参考条件


分选片段平均长度(bp)

250-350

320-420

450-550

550-700

700-900

800-1000

第一次体积比(磁珠:DNA)

0.80×

0.70×

0.60×

0.55×

0.50×

0.45×

第二次体积比(磁珠:DNA)

0.20×

0.20×

0.20×

0.15×

0.15×

0.15×



图2. Agilent 2100 high sensitivity DNA chipelectopherogram Smear fragments 溶于ddH2O,使用0.80×/0.20×至0.45×/0.15×磁珠进行片段分选