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集胞藻基因组改造

集胞藻基因组改造

集胞藻PCC 6803作为原核藻类基因编辑的黄金模式生物,基因编辑后可高效调控代谢通路,广泛应用于生物医药、医疗辅料及精准诊断领域。核心应用包括:肿瘤辅助治疗相关抗氧化成分(类胡萝卜素)规模化制备、医疗级酶制剂(如抗氧化酶)定向合成、诊断试剂用功能蛋白高效表达,同时可作为基因编辑技术研发的模式菌株,助力科研机构开展原核藻类基因调控机制研究。

基因编辑技术原理流程

核心采用CRISPR-Cas9/Cas12a编辑系统,结合同源重组技术,适配集胞藻PCC 6803清晰的遗传背景,流程标准化、可复制:①靶点设计与sgRNA合成:结合菌株基因组序列,精准设计特异性sgRNA,依托舒桐医疗高通量sgRNA筛选平台,筛选脱靶率最低的靶点;②载体构建:将sgRNA与Cas蛋白基因、同源臂片段(敲入/敲除片段)构建至适配载体,确保载体高效转化;③菌株转化:采用电穿孔法,将重组载体导入集胞藻细胞,实现载体高效整合;④阳性克隆筛选:通过抗性筛选+PCR验证,筛选出成功编辑的阳性菌株;⑤脱靶检测与验证:利用舒桐医疗核心脱靶检测技术,确认无脱靶风险,同时通过测序验证编辑准确性;⑥规模化培养:优化培养条件,实现阳性菌株规模化扩增,保障产物稳定积累。


集胞藻基因编辑改造策略[1]

服务类型

聚焦客户核心需求,提供全流程定制化服务,涵盖:①基因敲除服务:定向敲除无关代谢基因,提升目标产物积累量;②基因敲入服务:定向敲入外源功能基因(如医疗用酶基因、活性物质合成基因);③多基因调控服务:批量编辑多个靶点,实现代谢通路精准调控;④菌株改造优化:对现有编辑菌株进行二次优化,提升产物表达量与稳定性;⑤科研级/工业级菌株定制:根据客户研发或生产需求,定制专属编辑菌株。

技术优势

依托菌株特性与舒桐技术积淀,核心优势突出:

①编辑效率高:结合优化后的CRISPR-Cas12a系统,编辑效率可达95%以上,远超行业平均水平;

②脱靶率极低:搭配舒桐自主脱靶检测技术,可精准检测全基因组脱靶位点,确保编辑安全性;

③周期短:标准化流程加持,单个靶点编辑周期40-60天;

④转化效率高:适配电穿孔转化技术,菌株转化效率达90%以上,减少筛选成本;

⑤可规模化:编辑菌株可快速实现规模化培养,适配工业级生产需求;

⑥技术成熟:依托Nature Communications、ACS Synthetic Biology等经典文献技术成果,编辑体系经过长期验证,稳定性强。

项目周期及交付标准

项目周期:根据服务类型灵活调整,①单个靶点敲除/敲入:40-60天;②多基因调控(2-3个靶点):60-80天;③菌株定制与优化:60-80天;④规模化培养服务:根据培养量,20-30天(可与编辑服务同步进行)。

交付标准:①实物交付:阳性菌株(冻干粉+液体种子液)、规模化培养物(按需);②技术资料交付:靶点设计报告、sgRNA序列、载体构建图谱、转化与筛选记录、PCR验证报告、脱靶检测报告、测序报告、培养条件说明书;③售后保障:提供1对1技术指导,解答菌株培养、编辑后续应用相关疑问,必要时提供二次优化支持。

参考文献

[1] Cengic, I., Canadas, I. C., Minton, N. P.,& Hudson, E. P. (2022). Inducible CRISPR/Cas9 Allows for Multiplexed andRapidly Segregated Single-Target Genome Editing in Synechocystis Sp. PCC 6803.ACS Synthetic Biology, 11(10), 3100-3113.