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CRISPR功能基因组学筛选
⾏业背景
CRISPR功能基因组学筛选已成为药物靶点发现、耐药机制研究和基因功能注释的核心⼯具。通过构建覆盖全基因组的sgRNA文库,在细胞水平系统性地敲除/激活/抑制每⼀个基因,结合表型筛选,可以⾼通量地揭示基因与表型之间的因果关系。从肿瘤药物靶点发现到合成致死配对筛选,从免疫检查点挖掘到代谢通路解析,CRISPR筛选正在加速生物学发现和创新药研发进程。
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⾏业痛点
⽂库设计与构建
基因组文库sgRNA数量庞⼤(6-10万条),设计和合成成本⾼
⽂库均⼀性影响筛选质量,低质量⽂库导致假阴性
激活(CRISPRa)和抑制(CRISPRi)⽂库的设计逻辑不同于敲除⽂库

筛选执行
⼤规模细胞培养和⽂库感染操作复杂
筛选覆盖度(coverage)不⾜导致结果不可靠
筛选周期长,条件优化困难

数据分析
测序数据量⼤,分析流程复杂
候选基因排序算法(MAGeCK、BAGEL等)选择与参数优化
从hit list到可验证靶点的转化需要⽣物学洞察

验证与转化
筛选hit的单基因验证周期长
从细胞表型到动物模型的转化验证
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解决方案概述
舒桐科技提供覆盖"文库设计→文库构建→筛选执行→生信分析→候选验证"的全流程CRISPR筛选解决方案,支持敲除(CRISPRko)、激活(CRISPRa)、抑制(CRISPRi)三种筛选模式,助力客户高效发现药物靶点和功能基因。


核心服务
现货全基因组文库:
CRISPR-KO文库-基因敲除筛选
CRISPRa激活文库-基因过表达筛选
CRISPRi抑制文库-基因沉默筛选
定制文
客户指定基因集-特定研究需求