CRISPR定制文库
量身定制，精准匹配您的独特研究需求
在生命科学研究的前沿，创新往往意味着探索未知的领域。当您的研究对象是罕见疾病相关基因、非模式生物物种、特定突变位点，或需要整合多种CRISPR模式时，标准化的现货文库难以满足需求。您需要的是一个完全贴合研究目标、精准设计的专属工具。舒桐CRISPR定制文库服务为您提供高度个性化的解决方案。从基因选择、sgRNA设计到载体构建，每个环节都根据您的特定需求量身定制。我们不仅提供文库，更是您独特研究问题的专属技术伙伴。
图1 CRISPR定制文库服务流程及核心能力示意图
1. 什么是CRISPR定制文库?
CRISPR定制文库是根据客户特定研究需求，从零开始设计和构建的专属sgRNA文库。无论是针对特定基因集、突变位点、非模式生物，还是需要整合多种CRISPR模式，我们都能提供完全定制化的解决方案，确保文库与您的研究目标完美匹配。
2. 定制文库的核心优势
2.1 完全个性化设计
自定义sgRNA数量：根据实验需求调整每个基因的sgRNA
自由选择目标基因：从几十个到数千个基因，任意规模
特定位点靶向：可精确到外显子、结构域、突变位点
多模式整合：在同一文库中整合CRISPR-KO、CRISPRi、CRISPRa等多种模式
物种灵活：支持任何已测序物种，包括非模式生物
2.2 专业设计算法
最新sgRNA设计算法：整合活性预测、脱靶评估、染色质可及性等多维度参数
针对性优化策略：根据您的筛选类型(生存、增殖、表型等)优化设计
难点基因专门处理：对于GC含量异常、重复序列等难点基因提供特殊设计方案
物种特异性调整：针对不同物种的PAM序列、基因组特征进行优化
2.3 灵活载体选择
多种载体骨架：lentiCRISPR、lentiGuide系列等
不同启动子系统：组成型、诱导型、组织特异性
选择标记自定义：抗生素抗性、荧光蛋白等多种选择
特殊功能模块：条形码、报告基因、双向启动子等
2.4 严格质量控制
设计审核：博士后团队对设计方案进行专业审核
合成验证：Sanger测序验证关键sgRNA序列
文库NGS验证：深度测序确保覆盖度和均匀性
2.5 全程技术支持
设计阶段：深入沟通研究目标，提供专业设计建议
构建阶段：实时汇报进度，及时反馈问题
验证阶段：提供详细的质量检测报告和使用建议
应用阶段：实验方案优化、数据分析支持
3. 舒桐定制文库服务范围
3.1 特定基因集文库
根据您的研究问题，定制针对特定基因集的文库：
候选基因验证文库：基于前期筛选、GWAS研究或文献挖掘获得的候选基因列表
通路特异性文库：针对特定信号通路或生物学过程(如自噬、DNA修复、糖代谢等)
疾病相关文库：特定疾病(如罕见遗传病)的所有已知致病基因
染色体区域文库：特定染色体区域的所有基因，用于精细定位研究
3.2 非模式生物文库
为您关注的任何已测序物种设计和构建CRISPR文库：
农业动植物：水稻、小麦、番茄、猪、牛等
水产生物：斑马鱼、虾、鱼等
微生物：细菌、真菌、酵母等
新兴模式生物：灵长类、两栖类等
3.3 特殊位点靶向文库
精确到具体序列的靶向设计：
突变位点文库：特异性靶向肿瘤突变(KRAS G12D、TP53热点突变等)
结构域平铺文库：对蛋白功能结构域进行高密度平铺筛选
外显子靶向文库：特定外显子或剪接位点的精准敲除
非编码区文库：长非编码RNA、增强子、启动子等调控元件
3.4 多模式整合文库
在同一文库中整合不同CRISPR模式：
KO + CRISPRi：对同一基因集进行永久敲除和可逆敲低比较
CRISPRi + CRISPRa：同时调查基因沉默和激活的效应
Base Editor文库：C-to-T或A-to-G碱基编辑器文库，用于饱和突变筛选
Prime Editor文库：精准插入、删除、替换特定序列
3.5 组合筛选文库
用于研究基因间相互作用：
双sgRNA文库：每个载体包含两个sgRNA，用于基因对相互作用筛选
合成致死筛选：在特定基因突变背景下筛选合成致死伴侣
抑制子/增强子筛选：鉴定特定表型的遗传修饰因子
4. 舒桐一站式定制服务流程
4.1 第一阶段：需求分析与方案设计(1-2周)
4.1.1 深入需求沟通
了解研究背景、目标和期望结果
明确目标基因、物种、细胞系等关键信息
讨论特殊需求和技术挑战
4.1.2 专业方案设计
博士后团队评估项目可行性
提供多套备选设计方案
详细说明设计理念和预期效果
提供报价和时间线
4.1.3 方案确认
根据反馈调整优化方案
最终确认所有设计细节
签署技术协议和保密协议
4.2 第二阶段：文库构建与验证(8-12周)
4.2.1 sgRNA设计(1-2周)
运行专业设计算法生成候选sgRNA
脱靶分析和活性预测
人工审核和优化
4.2.2 文库合成(4-6周)
高通量寡核苷酸合成
载体克隆和扩增
质量控制检测
4.2.3 NGS验证(2-3周)
深度测序(通常>1000X覆盖度)
覆盖度和均匀性分析
生成详细验证报告
4.2.4 病毒包装(可选，1-2周)
高滴度慢病毒制备
滴度检测和质量评估
分装和冻存
4.3 第三阶段：交付与技术支持
4.3.1 完整交付
文库质粒或病毒
详细的设计文档和sgRNA列表
NGS验证报告
推荐实验方案
4.3.2 持续技术支持
实验操作指导
问题诊断和解决
数据分析协助
后续优化建议
5. 定制文库 vs 现货文库
如何决策？
选择定制文库，如果您：
研究非模式生物或特殊物种
需要针对特定基因集或突变位点的专属文库
要整合多种CRISPR模式(KO+CRISPRi+CRISPRa)
有特殊的sgRNA设计要求或载体系统需求
需要超高密度覆盖或平铺设计
项目具有开创性，标准文库无法满足
选择现货文库，如果您：
需要快速启动项目，时间紧迫
研究对象是常规模式生物(人、小鼠)
筛选目标是全基因组或主要功能基因集
希望使用经过验证的成熟文库，降低技术风险
预算相对有限，追求性价比
我们的博士后技术团队可以帮助您全面评估项目需求,推荐最优方案。很多情况下，现货文库+少量定制sgRNA的组合策略，既能快速启动，又能满足特殊需求。
6. 为什么选择舒桐定制文库？
6.1 专业团队
博士后科研工作站，强大研发实力
丰富的非模式生物文库设计经验
深刻理解不同研究需求的差异
6.2 技术领先
自主研发的sgRNA设计算法
持续更新的设计策略和质控标准
支持最新CRISPR技术(base editing, prime editing等)
6.3 灵活定制
完全根据您的需求设计
不受现货文库限制
支持各种特殊要求
6.4 质量保证
严格的NGS验证
可选的功能预验证
详细的质量报告
6.5 全程支持
从设计到应用的全流程服务
遇到问题及时响应解决
可选的数据分析服务
6.6 成功案例
服务超过100个定制项目
涵盖20+个物种
支持发表Nature、Science子刊等高分文献
联系我们
如果您有独特的研究需求，需要定制CRISPR文库，欢迎随时联系我们。我们的博士后技术团队将与您深入沟通，提供最适合的定制方案。
珠海舒桐生物科技有限公司
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参考文献
[1] Doench, J. G., et al. (2016). Optimized sgRNA design to maximize activity and minimize off-target effects of CRISPR-Cas9. Nature Biotechnology, 34(2), 184-191.
[2] Sanson, K. R., et al. (2018). Optimized libraries for CRISPR-Cas9 genetic screens with multiple modalities. Nature Communications, 9(1), 5416.
[3] Broad Institute GPP sgRNA Designer: https://portals.broadinstitute.org/gpp/public/analysis-tools/sgrna-design
[4] Hanna, R. E., & Doench, J. G. (2020). Design and analysis of CRISPR-Cas experiments. Nature Biotechnology, 38(7), 813-823.