联系我们
当前位置:
碱基编辑安全性评估解决方案

碱基编辑安全性评估解决方案

FDA 2024 Guidance · CDE Full Compliance

碱基编辑安全性评估
解决方案
DNA+RNA双维度全流程检测

碱基编辑技术实现了无双链断裂的精准单碱基转换,覆盖60%以上已知致病点突变。但其独特的双重脱靶机制(sgRNA依赖型+非依赖型)带来了远超传统CRISPR的安全性挑战,是监管机构审查的核心焦点。

从监管到解决方案的完整逻辑
01
监管强制要求FDA要求多方法正交验证DNA+RNA双维度脱靶
02
行业核心痛点非sgRNA依赖型脱靶无法预测,检测技术门槛高
03
舒桐全流程方案CBE/ABE专属检测+DNA+RNA双维度评估
ISO 9001 认证 · CNAS认可实验室
Detect-seq/Ino-seq 专属技术平台
符合FDA/CDE最新监管要求
服务 50+ 全球CGT企业
行业背景

基因编辑的下一代革命性技术

碱基编辑技术无需产生双链断裂即可实现精准单碱基转换,在遗传病和肿瘤治疗领域展现出巨大潜力。但其独特的脱靶机制给安全性评估带来了前所未有的挑战。

碱基编辑的双重脱靶机制

  • sgRNA依赖型脱靶:由Cas9在基因组同源序列处的错配结合引发,与传统CRISPR机制相似,具有可预测性
  • 非sgRNA依赖型脱靶:碱基编辑特有风险,脱氨酶结构域随机结合单链DNA或RNA,造成全基因组随机碱基转换和转录组编辑,无法通过序列同源性预测,是监管审查的核心

行业三大核心痛点

  • 技术门槛极高:非sgRNA依赖型脱靶必须依赖Detect-seq/Ino-seq等新兴技术,企业普遍缺乏内部能力
  • 供应商协调复杂:市场上能同时提供CBE/ABE全套检测服务的机构极少,需对接多家供应商
  • RNA脱靶评估困难:如何从转录组背景噪声中准确识别碱基编辑器诱导的RNA脱靶信号是行业难题
解决方案

三位一体全流程安全性评估体系

针对CBE和ABE的独特脱靶机制,我们构建了DNA+RNA双维度、多层次的综合检测策略,形成符合监管要求的完整证据链。

1

DNA水平脱靶检测平台

针对CBE和ABE分别采用专属检测技术:CBE使用Detect-seq特异性捕获脱氧尿苷(dU)中间体;ABE使用Ino-seq追踪脱氧肌苷(dI)产物。结合100X WGS和专用软件预测,实现sgRNA依赖型和非依赖型脱靶的全覆盖检测。

检测深度:≥100X WGS
2

RNA水平脱靶检测平台

通过全转录组测序(RNA-seq)专项分析流程,捕获碱基编辑器脱氨酶在转录组层面引发的随机RNA编辑事件。区分Alu重复区和非重复区编辑,对12种碱基编辑类型进行全面统计和注释,弥补DNA检测的盲区。

3

脱靶位点验证平台

结合液相杂交捕获测序(TES)与扩增子深度测序逐级验证。引入UMI唯一分子标识符技术,有效消除PCR扩增偏好性导致的假阳性,对候选脱靶位点进行高灵敏度定量验证,形成完整的监管证据链。

验证灵敏度:0.01%

CBE (胞嘧啶碱基编辑器) 检测方案

ABE (腺嘌呤碱基编辑器) 检测方案

  • CBEdeepoff 专用软件预测
  • 100X 全基因组测序(WGS)
  • Detect-seq 专属检测 (dU捕获)
  • TES液相杂交捕获验证
  • ABEdeepoff 专用软件预测
  • 100X 全基因组测序(WGS)
  • Ino-seq 专属检测 (dI追踪)
  • TES液相杂交捕获验证
我们的优势

为什么选择舒桐生物

我们拥有国内最完整的碱基编辑安全性评估技术链条,针对CBE和ABE的独特机制提供专属解决方案,深度理解全球监管要求。

全链条技术覆盖

国内少数同时具备CBE与ABE专属脱靶检测(Detect-seq/Ino-seq)、全基因组测序、转录组RNA脱靶检测及多种验证方法全流程服务能力的企业。采用标准化ISO 9001/CNAS认证流程,确保检测结果准确可靠。

专属技术平台

针对碱基编辑器的独特脱靶机制,自主建立Detect-seq(CBE专用)和Ino-seq(ABE专用)检测平台,可全面覆盖sgRNA依赖型、非依赖型、protospacer外编辑及靶向链编辑等全类型脱靶。

丰富的CGT行业经验

已成功服务多家头部CGT企业,深度理解碱基编辑产品IND申报的监管要求和技术难点。不仅提供检测数据,更提供符合监管要求的完整申报材料包,助力客户顺利通过IND审评。

灵活的服务模式

支持IND申报全流程打包与单项服务,可根据客户的具体需求和预算提供定制化方案。配备一对一专属项目经理全程跟踪,快速响应客户需求,确保项目高效推进和按时交付。

服务模式

灵活多样的服务选择

我们提供两种服务模式,满足不同客户在不同研发阶段的需求。

推荐

模式一:IND申报安全性评估包

适用场景

即将申报IND的客户,需要完整的安全性评估数据支持申报

服务内容
专用软件预测(CBEdeepoff/ABEdeepoff)100X WGS全基因组测序Detect-seq(CBE) 或 Ino-seq(ABE)RNA-seq转录组脱靶检测TES液相杂交捕获验证扩增子深度测序确证

交付内容:符合IND申报要求的完整检测报告 + 专家解读 + 申报支持

灵活

模式二:单项技术服务

适用场景

有明确单项检测需求的客户,可灵活组合

可选择服务
100X WGS测序Detect-seq(CBE)Ino-seq(ABE)RNA-seq转录组分析TES液相杂交捕获扩增子深度测序脱靶位点功能注释监管申报支持

交付内容:单项或多项检测数据报告 + 技术支持

客户价值

传统模式 vs 舒桐方案

选择我们的一站式解决方案,显著降低您的项目成本和周期,提高申报成功率。

核心价值对比

对比维度
传统模式
舒桐方案
需要对接的供应商数量
3-5家
1家
全流程项目周期
6-9个月
3-5个月
数据一致性
不同平台,难以比对
统一平台,数据可溯源
技术支持
分散对接,响应慢
一对一项目经理,全程跟踪
申报支持
仅提供数据
完整申报材料包 + 专家解读
立即咨询

正在开发碱基编辑产品?

告诉我们您的编辑器类型(CBE/ABE)和研发阶段,我们将为您定制符合FDA/CDE要求的碱基编辑安全性评估方案与详细时间线。