表观遗传学检测平台
基因编辑、载体转导及体外扩增培养过程可能引发表观遗传学层面的非预期变化,包括DNA甲基化模式改变、染色质开放性异常、组蛋白修饰重编程等,这些变化可能影响细胞分化潜能、免疫原性及功能稳定性,构成隐性安全风险。舒桐科技建立了多维度表观遗传学检测平台,全面解析细胞治疗产品的表观基因组特征。ATAC-seq(染色质可及性测序)技术通过捕获开放染色质区域,揭示转录因子结合位点、增强子活性变化及染色质重塑事件,评估基因编辑对基因调控网络的影响;CUT&Tag技术以低细胞量、高信噪比优势,实现组蛋白修饰(如H3K27ac、H3K4me3、H3K27me3)及转录因子结合的精准定位,适用于稀有细胞亚群的表观修饰图谱绘制。针对DNA甲基化检测,我们提供RRBS(简化代表性亚硫酸氢盐测序)、甲基化扩增子测序、甲基化靶向捕获测序等多种技术方案,覆盖全基因组、特定基因集或CpG岛的甲基化状态分析。对于表观编辑器(如dCas9-DNMT/TET融合蛋白)修饰的产品,我们提供WGBS(全基因组亚硫酸氢盐测序)进行单碱基分辨率的甲基化编辑效率与脱靶评估。iPSC及iPSC衍生细胞作为重点监管对象,平台提供iPSC编辑WGBS检测,确保重编程过程中的表观遗传记忆擦除及分化稳定性。所有检测结果整合生物信息学分析,关联基因表达谱变化,提供表观-转录组联合解读,支撑产品的CMC及安全性评价。