六篇摘要全部录用！舒桐医疗将亮相ASGCT 2026年会展示基因编辑安全评估全链条技术平台

珠海舒桐医疗（GeneRulor）共有六篇研究摘要被大会录用，将以Poster形式进行展示，充分展现了舒桐医疗在基因编辑安全评估与工具开发领域的系统性布局和创新实力。

此次入选的六项研究并非孤立的技术成果，而是一套覆盖基因编辑疗法开发全流程的技术平台——从编辑工具的开发优化，到脱靶检测与基因组安全性评估，形成了完整的技术闭环。

论文题目：Ino-seq enables comprehensive profiling of adenine base editor off-targets

腺嘌呤碱基编辑器（ABE）已进入临床试验阶段，但现有的脱靶检测方法仍存在明显短板：GUIDE-seq和CHANGE-seq-BE无法检测sgRNA非依赖性脱靶事件，全基因组测序（WGS）灵敏度极低（F1-score不足0.01）。

舒桐医疗自主开发的Ino-seq技术，通过核酸内切酶V直接切割含有肌苷的DNA——即ABE编辑的直接产物——实现了无偏倚、高精度的脱靶检测。在八个治疗靶点的系统评估中，Ino-seq取得了F1-score 0.892–0.931的卓越表现，验证精确度超过95.3%（1,330/1,396个位点获得验证），远超WGS（0.001–0.006）、GUIDE-seq（0.043–0.213）等现有方法。

尤其值得关注的是，Ino-seq独立发现了892个被所有其他方法遗漏的脱靶位点，其中47个位点的编辑率超过5%——在临床应用中，这些“隐形”脱靶将构成不可接受的安全风险。这一发现为IND申报阶段的基因毒性评估提供了全新的技术标准。

论文题目：LongTn-seq: A Novel Long-Read Tn5-Based Sequencing Platform for Comprehensive Quantification of AAV-Mediated HDR Efficiency and Genomic Safety Assessment

腺相关病毒（AAV）介导的同源定向修复（HDR）是实现精准基因插入的重要策略，但传统方法难以同时评估整合效率与基因组安全性。

舒桐医疗开发的LongTn-seq平台，将Tn5转座酶文库构建与PacBio长读长测序相结合，在单次实验中即可完成HDR整合效率定量、插入保真度分析和染色体重排检测。验证实验显示，该平台检测到72.29%的AAV-HDR整合率，同时精确刻画了小片段缺失（3.59%）、大片段缺失（1.32%）、插入（1.11%）及染色体倒位（0.02%）等全谱编辑结果，且染色体间易位事件极少（仅3个，0.05%），展示了良好的靶向特异性。

这是首个能够在单一实验中全面量化AAV-HDR效率并同步评估基因组安全性的技术方案，直接回应了FDA对基因组安全性评估的监管要求。

论文题目：Plug-in Base Editor: A Modular Platform for Programmable Control of Editing Windows, Efficiency, and Fidelity in DNA Base Editors

传统碱基编辑器将脱氨酶固定在Cas9的N端或C端，导致编辑窗口固定（通常在4–8位），约50%–75%的临床相关致病变异无法被有效纠正。

舒桐医疗开发的Plug-in BE系统，通过表位-抗体相互作用实现脱氨酶空间位置的动态重编程。团队在nCas9上设计了62个表位嵌入位点，系统评估了533种模块化组合。结果显示：Plug-in BE不仅将C-to-T编辑效率提升至约90%，还将副产物比例从25%–37%大幅降至2%–4%；在斑马鱼体内验证中，TWIST2位点的A8-to-G编辑效率实现了3.8倍提升，精确单碱基编辑比例从10%跃升至59%。

更具临床意义的是，ClinVar致病变异分析表明，Plug-in BE将可纠正的A-to-G变异比例从23.26%扩大至32.87%，C-to-T变异从43.53%扩大至77.73%，显著拓展了碱基编辑的治疗覆盖范围。

论文题目：Systematic high-throughput evaluation reveals FrCas9’s superior specificity and efficiency for therapeutic genome editing

SpCas9虽然应用广泛，但其脱靶活性始终是临床转化的安全隐忧。舒桐医疗通过自主建立的三阶段高通量筛选平台（AID-seq生化筛选 → 扩增子测序 → GUIDE-seq细胞验证），对来自Faecalibaculum rodentium的FrCas9进行了系统评估。

团队针对21个细胞与基因治疗相关靶基因（包括AAVS1、B2M、CD7、PDCD1、TRAC等）完成了sgRNA筛选，多个靶点的编辑效率超过70%（如hROSA26达91.3%、B2M达80.9%）。与SpCas9和OpenCRISPR-1相比，FrCas9展现出显著更优的特异性，脱靶位点大幅减少。TREX2融合进一步提升了基因组稳定性，减少了大片段缺失和易位事件。

论文题目：Structural and functional bases of F. rodentium Cas9 provide insights into CRISPR-Cas protein engineering

在上述功能验证的基础上，舒桐医疗进一步通过冷冻电镜（cryo-EM）解析了FrCas9-sgRNA-DNA三元复合物的高分辨率结构（2.89 Å），揭示了R-loop扩展态和预催化态两种功能状态。

研究发现FrCas9具有独特的sgRNA-DNA异源双链体过度扭转现象，以及磷酸锁定环（PLL）介导的错配敏感性调控机制——这些结构特征从分子层面解释了FrCas9为何具有更高的编辑精确性。基于结构洞见，团队通过理性工程设计获得了增强型eFrCas9变体，在保持靶向编辑活性的同时有效降低了脱靶效应，并在杜氏肌营养不良（DMD）模型细胞中成功验证了治疗潜力。

论文题目：Methodological Validation of Liquid-Phase Hybrid Capture for AAV Vector Integration Site Detection

AAV载体的基因组整合虽然发生率较低，但FDA和EMA已明确要求进行全面的整合安全性评估。传统的nrLAM-seq和LM-seq方法聚焦于ITR区域，容易遗漏非ITR整合事件。

舒桐医疗验证了液相杂交捕获法用于AAV整合位点检测的准确性、灵敏度和重复性。该方法使用覆盖AAV全序列的探针，成功检测到两个整合位点（均经Sanger测序验证），而nrLAM-seq和LM-seq均未检出。梯度稀释验证表明，该方法的检测限可达0.001%，满足临床前及临床开发阶段的监管合规要求。

纵观此次入选ASGCT的六项研究，可以清晰看到舒桐医疗的技术逻辑：

在编辑工具层面，Plug-in BE突破了传统碱基编辑器的窗口限制，FrCas9及其工程化变体提供了更高特异性的核酸酶选择；在安全评估层面，Ino-seq填补了碱基编辑器脱靶检测的关键空白，LongTn-seq实现了AAV-HDR全景安全评估，液相杂交捕获法则为AAV载体整合位点检测提供了高灵敏度的解决方案。

这套技术体系的核心价值在于：为基因编辑疗法从实验室走向临床提供可量化、可验证、可监管的安全评估工具链。